2016年，10x Genomics公司推出ChromiumTM系統(tǒng)，這是一套分子條形碼和分析系統(tǒng)，由儀器、試劑盒和信息學軟件組成，能全面對接Illumina測序儀。
木材形成影響木材的化學和物理性質，因此影響其作為建筑材料或生物燃料，紙漿和紙的原料的效用。為了獲得基因組范圍內對木材形成中轉錄組測序變化和調控網絡的見解，北京林業(yè)大學的研究人員使用高通量RNA測序來表征來自張力木(TW)，木材(OW)和成熟木質部的成熟木質部的cDNA文庫。普通木材(NW)，在工業(yè)樹種毛白楊(Populus tomentosa)中。
它們的測序產生140,978,316(TW)，128,972,228(OW)和117,672,362(NW)讀數(shù)，對應于10,127(TW)，10,129(OW)和10,129(NW)獨特基因。其中，361個基因在TW和OW之間差異轉錄(log2FC≥1或≤-1，F(xiàn)DR <0.05)，OW和NW之間差異為2,658，TW和NW之間差異為2,417。這表明NW與樹枝中的木材明顯不同; GO術語分析還表明OW經歷了更多的轉錄組測序重構。差異表達的基因包括97個編碼轉錄因子(TF)，40個參與激素信號轉導，33個參與木質素生物合成，21個參與類黃酮生物合成，43個參與細胞壁代謝，包括纖維素合成酶，蔗糖合成酶和COBRA。與TW或OW相比，超過一半差異表達的TF在NW中表現(xiàn)出低4倍以上的轉錄水平，表明不同木材類型的TF豐度差異顯著，并且可能在反應木材的形成中起重要作用。此外，與TW相比，參與木質素生物合成的大多數(shù)基因的轉錄物在OW中更豐富，這與OW的較高木質素含量一致。
基于不同基因的共表達模式，研究人員構建了兩個用于調節(jié)木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡，包括TF。最后，他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因。表明不同木材類型的TF豐度差異顯著，可能在反應木材的形成中起重要作用。此外，與TW相比，參與木質素生物合成的大多數(shù)基因的轉錄物在OW中更豐富，這與OW的較高木質素含量一致?；诓煌虻墓脖磉_模式，研究人員構建了兩個用于調節(jié)木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡，包括TF。最后，他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因。表明不同木材類型的TF豐度差異顯著，可能在反應木材的形成中起重要作用。
此外，與TW相比，參與木質素生物合成的大多數(shù)基因的轉錄物在OW中更豐富，這與OW的較高木質素含量一致?；诓煌虻墓脖磉_模式，研究人員構建了兩個用于調節(jié)木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡，包括TF。最后，他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因?；诓煌虻墓脖磉_模式，研究人員構建了兩個用于調節(jié)木質素和纖維素生物合成的轉錄組測序網絡，包括TF。最后，他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因?；诓煌虻墓脖磉_模式，研究人員構建了兩個用于調節(jié)木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡，包括TF。最后，他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因?！ ?/p>
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